تجزیه و تحلیل داده های چند امیکی عظیم، ژنتیک سرطان کولورکتال را رمزگشایی می کند

این مطالعه همچنین نشان داد که خطر ابتلا به سرطان کولورکتال ناشی از تغییر در عملکرد طبیعی کولورکتال در سطح مولکولی است: هموستاز، تکثیر، چسبندگی سلولی، مهاجرت، ایمنی و تعاملات میکروبی.

محققان داده های ژنومی افراد مبتلا به سرطان روده بزرگ و بدون سرطان روده بزرگ را برای شناسایی ارتباط ژنتیکی با این بیماری مقایسه کردند. این مطالعه با تجزیه و تحلیل داده های ژنومی، ترانسکریپتومی و متیلومیک، 250 ارتباط خطر مستقل را شناسایی کرد که 50 مورد از آنها قبلاً کشف نشده بودند. آنالیزها همچنین 155 ژن مؤثر با اطمینان بالا را پیدا کردند که مولکول‌هایی را رمزگذاری می‌کنند که بر فعالیت بیولوژیکی تأثیر می‌گذارند.

درک “تصویر کامل” سرطان کولورکتال

پس از شناسایی ژن‌ها، محققان می‌توانند بررسی کنند که کدام ژن‌های مرتبط با خطر باعث ایجاد تغییرات در سایر بافت‌های خارج از مخاط کولون می‌شوند، بافت پوششی روده بزرگ که در آن پولیپ‌های سرطانی ایجاد می‌شوند. نتایج نشان داد که بیش از یک سوم ژن‌های مؤثر به احتمال زیاد خارج از مخاط کولون عمل می‌کنند.

بر اساس این مقاله، این مطالعه دو برابر بیشتر از مطالعات قبلی مرتبط با ژنوم است. این همکاری شامل محققان وابسته به صدها مطالعه و موسسه در سراسر اروپا، آمریکای شمالی و آسیا بود، از جمله استفانی اشمیت، دکترا، MPH، نایب رئیس موسسه پزشکی ژنومیک کلیولند کلینیک. مطالعات ارتباط گسترده ژنوم در این مقیاس به محققان کمک می کند تا ژن های مرتبط با سرطان کولورکتال و همچنین مسیرهای بیولوژیکی تحت تاثیر این ژن ها را شناسایی کنند.

فرناندز-روزادیلا، سی.، و همکاران. (2022) رمزگشایی ژنتیک سرطان کولورکتال از طریق تجزیه و تحلیل چند omic 100204 مورد و 154587 کنترل از اجداد اروپایی و آسیای شرقی. ژنتیک طبیعت. doi.org/10.1038/s41588-022-01222-9.



منبع

دکتر استفانی اشمیت، دکترا، MPH، نایب رئیس موسسه پزشکی ژنومیک کلیولند کلینیک

تجزیه و تحلیل بیش از 100000 مورد سرطان کولورکتال و 154000 کنترل سالم منتشر شده در ژنتیک طبیعت صدها سیگنال را کشف کرد که ممکن است به عنوان اهداف جدید درمانی و پیشگیری عمل کنند.

دکتر اشمیت در میان گروهی بود که اولین نویسندگی را در این مطالعه به اشتراک گذاشت و به نمایندگی از مطالعه فرا رشته ای کولورکتال (CORECT) که توسط مؤسسه ملی بهداشت کمک مالی U19CA148107 تأمین شده بود، بود.

منبع:

سرطان کولورکتال از توده هایی به نام پولیپ در پوشش داخلی روده بزرگ ایجاد می شود. این بیماری سالانه بیش از 1.9 میلیون نفر را در سراسر جهان مبتلا می کند. اگرچه برخی از جهش‌های نادری که از طریق خانواده‌ها منتقل می‌شوند با خطر بسیار بالای سرطان روده بزرگ مرتبط هستند، اما بیشتر انواع ژنتیکی که در ایجاد سرطان کولورکتال نقش دارند در جمعیت رایج هستند و هر یک به تنهایی خطر افزایش بسیار کمی را به همراه دارند. ژنتیک در ترکیب با عوامل محیطی و سبک زندگی و رفتارهای غربالگری سرطان یکی از پازل های مهم این بیماری پیچیده است.

مرجع مجله:

یافته ها نشان می دهد که ژن های شناسایی شده می توانند بر سیستم های متعددی از جمله عملکردهای قلبی عروقی، عصبی و ایمنی تأثیر بگذارند. بر اساس این مقاله، میکروبیوتای روده نیز یک منطقه بالقوه مورد علاقه برای تحقیقات آینده است.

دکتر اشمیت می گوید، تجزیه و تحلیل جدید و همکاری مستمر، “تخته پرشی” برای تلاش های تحقیقاتی است که می تواند به عملکرد بالینی تبدیل شود.

این تلاش‌های اکتشافی کمک می‌کند تا مشخص شود که کدام راه‌ها در تحقیقات سرطان کولورکتال در حال پیشرفت است. داده‌های اضافی در مسیرهای بیولوژیکی اطلاعاتی را برای تشخیص خطر ژنتیکی سرطان کولورکتال و اینکه چگونه این بینش‌ها می‌توانند به طور بالقوه برای غربالگری طبقه‌بندی خطر و برای توسعه رویکردهای پیشگیری و درمان جدید استفاده شوند، ارائه می‌دهند.


دکتر اشمیت که برای اولین بار در طول دوره دکترای خود حدود یک دهه پیش شروع به کار بر روی بخشی از این تلاش کرد، می گوید: «این یک گام بزرگ در درک پیچیدگی استعداد ژنتیکی به سرطان کولورکتال است. «داده‌ها مسیرهایی را کشف کردند که می‌توانند پتانسیل پیشگیری و درمان بیماری را داشته باشند و مکانیسم‌های کاوش در خارج از روده بزرگ مانند سیستم ایمنی را تقویت کنند.»