تجزیه و تحلیل ژنوم ویروس آبله میمون نشان می دهد که این ویروس زودهنگام و رمزآلود پخش می شود


یک مطالعه جدید بر روی سرور پیش چاپ منتشر شده است bioRxiv* گزارش شناسایی خوشه‌ای از ژنوم‌های دودمان ویروس آبله میمون A.2 از سه کشور را گزارش می‌کند که از دودمان بسیار بزرگ‌تر B.1 مسئول شیوع فعلی متمایز است. این مشاهدات نشان می دهد که موارد آبله میمون A.2 بخشی از شیوع جهانی فعلی ویروس آبله میمون در سال 2022 نیست و در عوض از طریق زنجیره انتقال متفاوتی رخ داده است.

مطالعه: یک خوشه فیلوژنتیکی متمایز از ژنوم های آبله میمون، انتشار اولیه و پنهانی ویروس را نشان می دهد.  اعتبار تصویر: joshimerbin / Shutterstock.com

مطالعه: یک خوشه فیلوژنتیکی متمایز از ژنوم های آبله میمون، انتشار اولیه و رمزآلود ویروس را نشان می دهد. اعتبار تصویر: joshimerbin / Shutterstock.com

مقدمه

تا همین اواخر، ویروس آبله میمون در چندین کشور آفریقای مرکزی بومی بود و به طور معمول باعث ایجاد ضایعات منفرد یا چند تاولی می شد که اغلب خود به خود برطرف می شوند. عفونت با ویروس آبله میمون قبلاً با تماس با حیوانات شکار وحشی یا افراد مبتلا به این بیماری همراه بود.

از اوایل ماه مه 2022، ویروس آبله میمون در چندین منطقه غیر بومی جهان شناسایی شده است. این بیماران به ندرت سابقه سفر به کشورهای آندمیک را گزارش کرده اند و حدود 75 درصد از آنها سفر اخیر به کشورهای اروپایی دیگر را گزارش کرده اند. کسانی که در شیوع کنونی آلوده شده اند تقریباً منحصراً مردانی هستند که با مردان (MSM) رابطه جنسی دارند، به نظر می رسد که ویروس عمدتاً از طریق تماس جنسی منتقل می شود.

مشخصات علائم عفونت آبله میمون در طول شیوع فعلی نیز از فنوتیپ های قبلی تغییر کرده است، بنابراین تغییرات قابل توجهی در زیست شناسی ویروس نشان می دهد.

اولین عفونت آبله میمون شیوع فعلی به یک رویداد اروپایی بازمی گردد که در آن ویروس می توانست به بسیاری از افراد منتقل شود. پس از آن، ویروس به 75 کشور سرایت کرد و تا پایان جولای بیش از 20000 مورد جدید گزارش شد. در حال حاضر، شیوع ویروس آبله میمون به عنوان یک وضعیت اضطراری بهداشت عمومی با نگرانی بین المللی توسط سازمان بهداشت جهانی (WHO) تعیین شده است.

در نتیجه، نظارت ژنومی و آزمایش مولکولی افزایش یافته است، با چندین ژنوم توالی یابی شده در پایگاه داده ابتکار جهانی برای به اشتراک گذاری همه داده های آنفلوانزا (GISAID) آپلود شده است. ژنوم آبله میمون حدود 200 جفت کیلوباز دارد که شامل دو رشته اسید دئوکسی ریبونوکلئیک (DNA) آن است.

اخیراً، 9 ژنوم از ایالات متحده، تایلند و هند از شش جدایه بالینی که به یک اصل و نسب متفاوت، A.2 نگاشت، بر روی GISAID آپلود شد. این دودمان متشکل از 16 جهش منحصر به فرد است که 9 تای آنها غیر مترادف هستند.

با پیروی از مدل فیلوژنتیک، محققان مؤسسه ژنومیک و زیست شناسی یکپارچه CSIR (CSIR-IGIB) تلاش کردند تا زمان آخرین جد مشترک (tMRCA) این دودمان را تخمین بزنند.

یافته های مطالعه

tMRCA دودمان A.2 در 25 ژوئن 2021 بود. میانگین نرخ جایگزینی نوکلئوتید بسیار کمتر از دودمان B.1 در 5.53 x 10 بود.-5 در مقایسه با 1.13×10-4به ترتیب، با افزایش نرخ جایگزینی B.1.

بنابراین، دودمان A.2 ممکن است حتی سال ها قبل از شیوع اوایل سال 2022 شروع به گسترش کرده باشد، به خصوص که اولین ژنوم از نمونه جمع آوری شده در جولای 2021 بود.

ژنوم های مورد تجزیه و تحلیل در مطالعه حاضر از مردانی که به امارات متحده عربی یا نیجریه سفر کرده بودند به دست آمد. این نشان دهنده یک زنجیره جداگانه انتقال بین انسان ها بدون انتقال مستقیم مشترک انسان و دام در سراسر مرزهای بین المللی است. نکته مهم، این گسترش تا زمان مطالعه فعلی ناشناخته باقی ماند.

این زنجیره انتقال ممکن است با شیوع بزرگ آبله میمون که در سال 2022 رخ داد و به دلیل افزایش آگاهی، نظارت و در دسترس بودن گسترده تر تشخیص ها به طور بالقوه کشف شده باشد، مرتبط نباشد.

یافته‌های مطالعه بر اهمیت نظارت ژنومی همه پاتوژن‌های تازه در حال ظهور برای سیاست‌های بهداشت عمومی و بینش‌های اپیدمیولوژیک تأکید می‌کنند.

*تذکر مهم

bioRxiv گزارش‌های علمی مقدماتی را منتشر می‌کند که توسط همتایان مورد بررسی قرار نگرفته‌اند و بنابراین، نباید به‌عنوان نتیجه‌گیری، راهنمای عمل بالینی/رفتار مرتبط با سلامتی در نظر گرفته شوند یا به عنوان اطلاعات ثابت تلقی شوند.



منبع