رویکرد شخصی‌سازی توالی‌یابی کل ژنوم می‌تواند میزان تشخیص بیماری‌های نادر را دو برابر کند

از

محققان درگیر در این مطالعه توسط شورای تحقیقات پزشکی تامین مالی می شوند.

داستان بیمار

پروفسور مایکل هانا، مدیر مؤسسه نورولوژی کوئین اسکوئر UCL، گفت: “این کار گامی مهم به جلو در توسعه بهترین روش ها برای به حداکثر رساندن مزایای تجزیه و تحلیل ژنوم برای بیماران است. این به وضوح نشان می دهد که با ترکیب رویکردهای خودکار برای تجزیه و تحلیل ژنوم با داده ها. تفسیر توسط یک تیم چند رشته ای ماهر، میزان تشخیص دو برابر می شود.

دریافت تشخیص ژنتیکی مهم است زیرا به بیماران اجازه می دهد تا به برنامه ریزی خانواده، IVF تخصصی و آزمایشات دارویی دسترسی داشته باشند. همچنین می تواند غربالگری هدفمند عوارض شناخته شده بیماری و دسترسی به مطالعات دارویی را امکان پذیر کند.

نویسنده اصلی، دکتر رابرت پیتچالی (سرویس مشترک خدمات بسیار تخصصی NHS لندن برای اختلالات نادر میتوکندری و رهبر گروه تحقیقاتی در موسسه نورولوژی کوئین اسکوئر UCL) گفت: “NHS سرمایه گذاری زیادی در فناوری های ژنتیکی پیشرفته انجام داده است. بریتانیا خود را در خط مقدم توالی یابی کل ژنوم تشخیصی قرار داده است.بنابراین، برخی از افراد مبتلا به بیماری های ژنتیکی نادر پس از تجزیه و تحلیل ژنوم بدون تشخیص مولکولی باقی می مانند.

هر چیزی که به من کمک کند آنچه را که در بدنم می‌گذرد درک و درک کنم، به من کمک می‌کند تا با آن کنار بیایم و به من اطمینان می‌دهد که آن را به بهترین شکل ممکن مدیریت می‌کنم.»

این کار شامل 102 بیمار تشخیص داده نشده مشکوک به داشتن یک بیماری اولیه میتوکندری (گروه بزرگی از اختلالات ژنتیکی صعب العلاج که کودکان و بزرگسالان را تحت تاثیر قرار می دهد، مرتبط با طیف وسیعی از مشکلات پزشکی، ناتوانی های شدید و کاهش طول عمر) بود که تحت کل ژنوم قرار گرفته بودند. توالی یابی از طریق پروژه 100000 ژنوم NHS.

“ما معتقدیم سرمایه گذاری در تیم های تخصصی پزشکی ژنومیک بسیار مهم است و دسترسی عادلانه به تخصص چند رشته ای اختصاصی و به حداکثر رساندن تشخیص ها را تضمین می کند. به طور متوسط، بیماران در مطالعه ما بیش از 30 سال برای تشخیص صبر کردند – ما اکنون توانایی حل چنین مواردی را داریم اما نیاز به تشخیص کافی داریم. برنامه ریزی نیروی کار برای حمایت از آزمایشگاه های ژنتیک تشخیصی NHS در دستیابی به این هدف.”

با این حال، تفسیر این داده ها می تواند بسیار چالش برانگیز باشد و بسیاری از افراد مبتلا به بیماری های ژنتیکی پیچیده و نادر هنوز پاسخی مولکولی برای علت مشکلات خود دریافت نمی کنند.

منبع:

مرجع مجله:

دانشگاه کالج لندن

دکتر Pitceathly گفت: “در این مطالعه، هر تشخیص ژنتیکی جدید تاثیر مستقیمی بر مراقبت از بیمار داشت. این شامل بررسی های اضافی برای مشکلات قلبی، کم شنوایی و دیابت و دسترسی به آزمایش های بالینی بود.”

این مطالعه اهمیت همکاری بین پزشکان متخصص و دانشمندان ژنتیک را در تفسیر نتایج توالی‌یابی ژنوم برای به حداکثر رساندن فرصت دستیابی به یک تشخیص که سپس می‌تواند به هدایت گزینه‌های مدیریت پزشکی و درمان کمک کند، برجسته می‌کند.


دکتر جیمز دیویسون، یکی از نویسندگان بخش پزشکی متابولیک در بیمارستان گریت اورموند استریت و رئیس گروه بیماری های متابولیک ارثی بریتانیا

در مطالعه منتشر شده در ارتباطات طبیعت، محققان مرکز میتوکندری لندن در موسسه نورولوژی کوئین اسکوئر UCL و موسسه بهداشت کودکان UCL Great Ormond Street به دنبال ارائه شانس بهتری برای دریافت تشخیص ژنتیکی به چنین بیمارانی بودند.

این رویکرد شخصی، میزان تشخیص را از 16.7٪ به 31.4٪ افزایش داد. همچنین در 3.9 درصد از بیماران، انواع بالقوه ایجاد کننده بیماری را شناسایی کرد.

“داشتن یک تشخیص به من این امکان را می دهد که در مورد وضعیت خود تحقیق کنم و در مدیریت آن بسیار فعال باشم.

مکن، دبلیو ال، و همکاران (2022) ورودی چند رشته ای تخصصی تشخیص بیماری های نادر را از توالی یابی کل ژنوم به حداکثر می رساند. ارتباطات طبیعت doi.org/10.1038/s41467-022-32908-7.



منبع

سفر به دستیابی به تشخیص برای کودکان و بزرگسالان مبتلا به شرایط نادر، پیچیده و پزشکی می‌تواند یک فرآیند بسیار طولانی باشد و پزشکی ژنومیک ابزاری دگرگون‌کننده و قدرتمند برای کمک به رسیدن به آن هدف فراهم می‌کند.


“تعجب در مورد آن انرژی زیادی می گرفت و من نگران پسر 12 ساله ام بودم و اینکه آیا وضعیت من بر او تاثیر می گذارد یا خیر. بنابراین، تشخیص نادر مغلوب یک تسکین بود و ترس از ناشناخته ها را از بین می برد.

در سال 2018، دپارتمان بهداشت بریتانیا خدمات پزشکی ژنومیک NHS را اعلام کرد که به بیماران مبتلا به بیماری‌های نادر اجازه می‌دهد تا کل کد ژنتیکی خود را به امید ارائه یک تشخیص بسیار مورد نیاز خوانده شوند.

برای انجام این کار، آنها آزمایش کردند که چگونه با استفاده از یک تیم پزشکی ژنومیک متشکل از پزشکان متخصص، بیوانفورماتیکان و دانشمندان می‌توان توانایی‌های آزمایشگاه‌های تشخیصی NHS را فراتر از تجزیه و تحلیل استاندارد نیمه خودکار داده‌ها افزایش داد. تیم UCL موارد تشخیص داده نشده را مجددا ارزیابی کرد تا سرنخ هایی را شناسایی کند که ممکن است به هدایت تجزیه و تحلیل بیشتر و شخصی تر کمک کند. آنها متعاقباً از روش‌های بیوانفورماتیک اضافی استفاده کردند و از فناوری‌های رایانه‌ای پیشرفته برای شناسایی تغییرات ژنتیکی در DNA بیماران استفاده کردند که ممکن است باعث بیماری شود اما در آزمایش‌های معمول نادیده گرفته شده بود.

او گفت: «در طول 20 سال گذشته به بیمارستان‌های زیادی مراجعه کرده بودم و آنقدر جستجو می‌کردم، هرگز فکر نمی‌کردم تشخیص بدهم.

یک مطالعه جدید به رهبری محققان UCL نشان می‌دهد که تطبیق آنالیز توالی‌یابی کل ژنوم برای بیماران فردی می‌تواند میزان تشخیص بیماری‌های نادر را دو برابر کند.

ریچل نورث یکی از بیمارانی بود که در کارآزمایی شرکت داشت و تشخیص را به عنوان “تغییر زندگی” توصیف کرد. از آن زمان به او اجازه داده شد تا از نظر عوارض بیماری مانند استئوپنی غربالگری شود و این موارد تحت درمان قرار گرفتند.