در سال های اخیر، برخی از انواع جدید از پلاسمودیوم فالسیپاروم ظهور کرده و در داخل گسترش یافته است منطقه فرعی مکونگ بزرگ، جایی که انتقال پاتوژن و مرگ و میر مربوط به آن کم است. این گونه‌ها به چندین دارو از جمله آرتمیزینین، مفلوکین و پیپراکین مقاومت نشان داده‌اند و در نتیجه می‌توانند به راحتی از مداخلات درمانی موجود فرار کنند.
از دست دادن قابل توجهی تنوع ژنتیکی در نمونه های جمع آوری شده از استان آتاپئو در طی شیوع های اخیر در سال 2020 مشاهده شد. دانشمندان فرض کردند که کاهش تنوع می تواند به دلیل افزایش جمعیت باشد.
لائوس کشوری در منطقه بزرگ مکونگ است که هدف آن حذف انتقال بیماری است پلاسمودیوم فالسیپاروم تا سال 2023. با وجود اجرای دقیق اقدامات بهداشت عمومی، شیوع ناگهانی پلاسمودیوم فالسیپاروم در استان آتاپئو در فصل مالاریا 2020-2021 رخ داد.
در مطالعه حاضر، دانشمندان ویژگی‌های ژنتیکی انواع مقاوم به چند دارو را که مسئول شیوع مالاریا در استان آتاپئو، لائوس هستند، تجزیه و تحلیل می‌کنند.
یافته های مطالعه حاکی از موارد اخیر است پلاسمودیوم فالسیپاروم شیوع بیماری در Attapeu، لائوس توسط جهش های مفید مرتبط با فنوتیپ های مقاوم در برابر چند دارو از انواع شیوع ایجاد می شود.
گونه ای که به سرعت در حال گسترش بود LAA1 (84٪) بود که در درجه اول مسئول کاهش تنوع ژنتیکی بود. دومین نوع بزرگ LAA2 بود که به تدریج گسترش یافت و به فرکانس 8% در سال 2021 رسید. سومین نوع بزرگ LAA7 بود که با القاء در گسترش LAA1 گسترش آن در طول زمان کاهش یافت.
پلاسمودیوم فالسیپاروم یک انگل کشنده مسئول مرگبارترین شکل مالاریا، به ویژه در جنوب صحرای آفریقا است. با این وجود، اجرای درمان‌های ترکیبی بسیار موثر مبتنی بر آرتمیزینین، همراه با اقدامات بهداشت عمومی سخت‌گیرانه، میزان مرگ و میر ناشی از مالاریا را در چند دهه گذشته به طور قابل‌توجهی کاهش داده است.
در تلاش برای شناسایی جمعیت افراد بسیار مرتبط، فواصل ژنتیکی جفتی تخمین زده شد و برای خوشه‌بندی انگل‌های مشابه ژنتیکی استفاده شد. در مجموع 30 خوشه شناسایی شد.
این گونه ها ممکن است سال ها با فرکانس پایین در گردش باشند. ایجاد شرایط مساعد برای انتخاب، مانند تغییر در درمان‌های خط مقدم، می‌تواند به ظهور جهش‌های مفید و گسترش سریع کلونال واریانت‌ها منجر شود.
حدود 130 درصد القای موارد مالاریا در استان آتاپئو در طول فصل مالاریا 2020-2021 مشاهده شد. تجزیه و تحلیل‌های ژنتیکی انجام‌شده در مطالعه حاضر تنوع پایدار بارکدهای ژنتیکی را در طول دوره 2017-2019 نشان داد که مشابه آن چیزی بود که بین سال‌های 2011-2012 مشاهده شد.
ارتباط قوی بین ظهور جهش R539T و شروع شیوع در Attapeu مشاهده شد. این جهش در سایر استان های لائوس یافت نشد. با این حال، قبل از شیوع در آتاپیو با فرکانس پایین وجود داشت.
به طور کلی، این مشاهدات نشان می‌دهد که شیوع جهش‌ها توسط جهش‌های مفیدی انجام می‌شود که فراوانی آن افزایش یافته و در یک جمعیت مشخص ثابت شده است، که در غیر این صورت به عنوان یک جارو انتخابی شناخته می‌شود.
تجزیه و تحلیل جهشی انواع شیوع
مطالعه اخیر منتشر شده در بیماری های عفونی لانست مجله اپیدمیولوژی ژنتیکی و پویایی انگل را توصیف می کند پلاسمودیوم فالسیپاروم مسئول شیوع مالاریا در استان آتاپئو، لائوس، در طول فصل مالاریا 2020-2021.
تجزیه و تحلیل خوشه ای نشان داد که گسترش سریع کلونال یک سویه انگل مقاوم به چند دارو حامل جهش R539T مسئول شیوع اخیر در Attapeu است. سه گونه از سویه غالب شناسایی شد و به عنوان LAA1، LAA2، و LAA7 نامگذاری شد.
تجزیه و تحلیل بیشتر نشان داد که LAA1 حدود 58 درصد از ژنوم خود را از سویه‌ای که قبلاً در کامبوج در گردش بود در سال 2008 به ارث برده است. در واقع، ژنوم LAA2 با سویه کامبوجیایی سال 2009 یکسان بود. سویه مقاوم به پیپراکین با جهش R539T.
اهمیت مطالعه
ژنوتیپ جدایه های شیوع نشان داد که همه انواع انگل حامل آلل های مرتبط با مقاومت به کلروکین، سولفادوکسین، پیریمتامین و آرتمیزینین هستند. در حالی که نوع LAA2 دارای جهش C580Y بود، هر دو LAA1 و LAA7 دارای جهش R539T بودند.
مراجع مجله:
- Wasakul، V.، Disratthakit، A.، Mayxay، M.، و همکاران (2022). شیوع مالاریا در لائوس توسط یک جارو انتخابی برای جهش‌یافته‌های پلاسمودیوم فالسیپاروم kelch13 R539T: تجزیه و تحلیل اپیدمیولوژی ژنتیکی. بیماری های عفونی لانست. doi:10.1016/S1473-3099(22)00697-1.
مطالعه: شیوع مالاریا در لائوس توسط یک جارو انتخابی برای جهش‌یافته‌های پلاسمودیوم فالسیپاروم kelch13 R539T: تجزیه و تحلیل اپیدمیولوژی ژنتیکی. اعتبار تصویر: PPK_studio / Shutterstock.com
زمینه
برخی از این گونه ها قبل از سال 2019 با فرکانس پایین در گردش بودند. با این حال، در سال 2021، به دلیل گسترش کلونال تهاجمی، آنها به گونه های غالب (94٪) در گردش تبدیل شدند.
به عنوان بخشی از نظارت ژنتیکی معمول، مقامات بهداشت عمومی جنوب لائوس 249 نمونه را از استان آتاپئو در طول شیوع بیماری جمع آوری کردند. در تلاش برای درک ویژگی‌های اپیدمیولوژیک انگل شیوع، این نمونه‌ها ژنوتیپ شدند و امضای ژنتیکی آنها با انگل‌های در حال گردش در فصول گذشته و سایر مناطق جغرافیایی مقایسه شد.
مشاهدات مهم
