مطالعه نشان می‌دهد که خفاش‌ها یک مخزن ویروسی هستند که کمتر شناخته شده است

در مطالعه اخیر منتشر شده در مجله مرکز کنترل و پیشگیری از بیماری های ایالات متحده (CDC) بیماری های عفونی در حال ظهورتیمی از محققان، شناسایی آرنا ویروس ریبونوکلئیک اسید (RNA) را از گونه‌های مختلف خفاش‌های نمونه‌برداری شده بین سال‌های 2007 تا 2011 از برزیل گزارش کردند.

زمینه

از چهار جنس موجود در خانواده ویروس Arenaviridae، Mammarenavirus تنها جنس است که پستانداران را مبتلا می کند. این جنس به آرناویروس های دنیای جدید و سروکامپلکس ویروس کوریومننژیت-لاسا که در سراسر جهان توزیع شده است، تقسیم می شود. برخی از arenavirus های دنیای جدید مانند ویروس های Junin، Chapare، Guanarito، Machupo و Sabia باعث ایجاد تب خونریزی دهنده در انسان می شوند.

در حالی که arenaviruses بیماری زا عموماً از طریق جوندگان آلوده به انسان منتقل می شوند. Tacaribe mammarenavirus، در خفاش ها یافت می شود و برای انسان عفونی تلقی نمی شود، به طور حکایتی شناخته شده است که باعث علائم آنفولانزا می شود. اگرچه خفاش ها میزبان ویروس های مشترک بین انسان و دام هستند، شواهد اپیدمیولوژیک محدودی در مورد ارتباط بین خفاش ها و آرنا ویروس ها وجود دارد که عمدتاً از یک ویروس جدا شده و عفونت های تجربی خفاش ها تشکیل شده است.

با این حال، از آنجایی که ویروس Tacaribe متعلق به همان دسته ویروس‌های عامل تب خونریزی‌دهنده است که فرار ایمنی و تروپیسم سلولی را نیز نشان می‌دهند، امکان عفونت شدید از ویروس تاکاریبه را نمی‌توان رد کرد.

در مورد مطالعه

در مطالعه حاضر، محققان نمونه‌های خفاش را از جنوب شرقی برزیل جمع‌آوری کردند و بافت‌های طحال، ریه، روده، کلیه‌ها و کبد را از نمونه‌ها آنالیز کردند. آنها در مجموع 1047 خفاش را از 32 گونه جمع آوری کردند و 3670 نمونه بافت را تجزیه و تحلیل کردند. برای شناسایی RNA arenavirus، آنها واکنش زنجیره ای پلیمراز رونویسی معکوس (RT-PCR) را با آغازگرهای اصلاح شده برای تقویت توالی های جزئی ژن RNA پلیمراز وابسته به RNA arenaviruses جهان جدید انجام دادند.

علاوه بر این، آنها از توالی یابی عمیق مبتنی بر Illumina برای به دست آوردن توالی کدگذاری کامل آرناویروس ها از دو گونه از خفاش های جمع آوری شده استفاده کردند. توالی های به دست آمده از RT-PCR و توالی های کد کننده کامل برای آنالیزهای فیلوژنتیکی و تعیین فواصل توالی همگن استفاده شدند.

نتایج

نتایج RNA arenavirus را از 1.62٪ (17 از 1047) از خفاش های نمونه برداری شده متعلق به سه گونه – یک گونه گزارش کردند. Artibeus planirostris، چهار Artibeus lituratus، و 12 کارولیا پرسپیسیلاتا. ویروس های این دو آرتیبیوس گونه ها به عنوان شناسایی شدند Tacaribe mammarenavirus، در حالی که ویروس در 12 شناسایی شد کارولیا پرسپیسیلاتا نمونه ها به عنوان یک گونه جدید شناسایی شدند که نویسندگان آن را نامیدند Tietê mammarenavirus.

همه نمونه‌ها از مناطق جنگلی و شهری در فاصله 60 کیلومتری از یکدیگر جمع‌آوری شدند که نشان‌دهنده وجود مخزن ویروسی احتمالی در خفاش‌های منطقه است. غلظت‌های ویروسی مشابهی در بافت‌های طحال و ریه‌ها یافت شد که نشان‌دهنده عفونت سیستمیک است. بالاترین غلظت arenavirus در نمونه بافت روده یافت شد که نشان دهنده ریزش ویروس روده است.

بازسازی فیلوژنتیکی بر اساس توالی‌های ژن RNA پلیمراز وابسته به RNA جزئی، دو کلاد آرناویروس جهان جدید را در برزیل بازیابی کرد. arenaviruses از این دو آرتیبیوس گونه ها یک کلاد را تشکیل دادند، در حالی که توالی ها از کارولیا پرسپیسیلاتا نمونه ها کلاد دیگری را تشکیل دادند. توالی‌های کدگذاری کامل سازمان‌دهی ژنومی مشابهی با سایر ویروس‌های پستاندار نشان دادند و یک گروه تک‌فیلتیک با ویروس تاکاریبه تشکیل دادند که به خوبی پشتیبانی می‌شد.

درخت حداکثر احتمال با استفاده از ژن‌های بخش بزرگ کامل، کل کلاد حاوی ویروس تاکاریبه و توالی‌هایی را از برزیل به‌عنوان خواهری با آرناویروس‌های Junin و Machupo New World بازیابی کرد.

با این حال، تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک با استفاده از ژن‌های قطعه کوچک کامل، رابطه خواهری بین ویروس Ocozocoautla de Espinosa و کلاد با توالی‌های برزیلی و توالی‌های ویروس تاکاریبه را نشان داد.

تصور می شود که ویروس Ocozocoautla de Espinosa باعث شیوع تب خونریزی دهنده در مکزیک شده است. علاوه بر این، آنالیزهای نوترکیبی و فواصل توالی هیچ رویداد نوترکیبی را نشان ندادند.

ارزیابی طبقه بندی گونه های ویروس جدید از کارولیا پرسپیسیلاتا نمونه ها بر اساس مقایسه توالی دوتایی با ویروس تاکاریب بود که نشان دهنده هویت توالی نوکلئوتیدی کمتر از 80٪ و هویت اسید آمینه پروتئین نوکلئوکپسید از 88.6٪ تا 90٪ و حضور یک میزبان متمایز بود. نام این گونه از رودخانه ای که در نزدیکی محل نمونه برداری قرار داشت گرفته شد.

نتیجه گیری

به طور خلاصه، این مطالعه گونه های خفاش جمع آوری شده از جنوب غربی برزیل را برای حضور RNA arenavirus با استفاده از روش های تقویت توالی بررسی کرد. نتایج حضور RNA arenavirus از سه گونه خفاش را گزارش کردند که 1.62٪ از کل حجم نمونه را شامل می شود.

آنالیزهای فیلوژنتیکی نشان داد که آرناویروس‌های شناسایی‌شده از نمونه‌های خفاش ارتباط نزدیکی با ویروس Tacaribe، یک arenavirus دنیای جدید که در خفاش‌ها یافت می‌شود، دارند. یکی از آرناویروس‌های کشف‌شده، گونه‌ای جدید است و به آن نام داده شده است Tietê mammarenavirus.

در حالی که arenavirus های دنیای جدید به طور کلی در جوندگان یافت می شوند، نتایج این مطالعه نشان می دهد که خفاش ها می توانند مخازن arenavirus باشند و نیاز به کاوش بیشتر دارند.