مطالعه پروتکل‌های آزمایش PCR آبله میمون و کارایی را در دو آزمایشگاه مرجع ایالات متحده مقایسه می‌کند.


در مطالعه اخیر ارسال شده به medRxiv* سرور پیش چاپ، محققان شیوه های جمع آوری نمونه، ویژگی های اپیدمیولوژیک و مقادیر آستانه چرخه (Ct) را برای آزمایش های واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) مورد استفاده در دو آزمایشگاه مرجع در ایالات متحده (ایالات متحده) برای شناسایی ویروس آبله میمون (MPXV) مورد بررسی قرار دادند.

مطالعه: عملکرد و روند بالینی در طی دو ماه اول آزمایش PCR ویروس آبله میمون در دو آزمایشگاه مرجع ایالات متحده.  اعتبار تصویر: Salov Evgeniy / Shutterstockمطالعه: عملکرد و روند بالینی در طی دو ماه اول آزمایش PCR ویروس آبله میمون در دو آزمایشگاه مرجع ایالات متحده. اعتبار تصویر: Salov Evgeniy / Shutterstock

زمینه

شیوع اخیر آبله میمون در کشورهای غیر بومی مانند ایالات متحده منجر به افزایش تست تشخیصی MPXV PCR شده است. آبله میمون توسط یک ویروس در بدن ایجاد می شود ارتوپاکس ویروس جنس، شبیه به آبله زا واریولا ویروس. با ریشه کن کردن تقریبا کامل آبله، اکثر کشورها واکسیناسیون آبله را متوقف کردند و شکاف هایی در ایمنی ایجاد کردند.

کاهش قابل توجه در گسترش ارتوپاکس ویروس ها همچنین باعث ناآشنا بودن پزشکان با عفونت های ارتوپاکس ویروس و امکانات کمتری برای تست های تشخیصی شده است. قبل از شیوع 2022، آزمایش MPXV فقط در آزمایشگاه‌های مورد تایید سازمان غذا و داروی ایالات متحده (FDA) یا توسط مراکز کنترل و پیشگیری از بیماری‌ها (CDC) انجام می‌شد. بین ژوئن و ژوئیه 2022، آزمایشات آزمایشگاهی و مجاز FDA برای آبله میمون به آزمایشگاه‌های بالینی گسترش یافت.

در حالی که آزمایشگاه‌های بالینی و مرجع می‌توانند تعداد بسیار بیشتری از موارد را نسبت به مراکز بهداشتی عمومی پردازش کنند و نتایج آزمایش‌های کیفی را به CDC و بخش‌های بهداشت ایالتی گزارش کنند، داده‌هایی مانند مقادیر Ct و عملکرد آزمایش به طور منظم گزارش نمی‌شوند. نظارت بر این داده ها می تواند به شناسایی انواع نوظهور و بهبود شیوه های آزمایش کمک کند.

در مورد مطالعه

مطالعه حاضر داده‌های آزمایش MPXV PCR را از دو آزمایشگاه مرجع در ایالات متحده – آزمایشگاه ویروس‌شناسی دانشگاه واشنگتن (UW) در سیاتل، واشنگتن، و آزمایشگاه‌های ARUP (ARUP) در سالت لیک سیتی، یوتا مورد بررسی قرار داد. داده های بررسی شده شامل اطلاعات بیش از 10000 نمونه جمع آوری شده بین جولای و آگوست 2022 بود.

عوامل اپیدمیولوژیک توصیفی مانند توزیع سن و جنس در آزمایش MPXV PCR در دو آزمایشگاه مقایسه شد. علاوه بر این، محققان میانگین مقادیر Ct را در هر دو آزمایشگاه بررسی کردند تا بارهای ویروسی شناسایی شده در آزمایش‌های PCR را مقایسه کنند. در نهایت، تطابق نتایج آزمایش با استفاده از درصد بیمارانی که سواب های متعدد ارائه کرده بودند، مقایسه شد.

نتایج

نتایج افزایش آزمایش را در بین مردان 18 تا 40 ساله گزارش کرد که در معرض خطر بیشتر آبله میمون قرار داشتند. نویسندگان مشاهده کردند که نرخ مثبت با افزایش تعداد نمونه های ارسالی کاهش می یابد. آنها همچنین تعداد قابل توجهی از نتایج تست مثبت را در میان مردان نسبت به زنان شناسایی کردند، که با سایر نتایج مطالعاتی که بروز بیشتر عفونت آبله میمون را در مردانی که با مردان رابطه جنسی دارند، مطابقت دارد.

مقادیر Ct بین دو آزمایشگاه مرجع قابل مقایسه بود، با آزمایش‌های آزمایشگاهی ARUP که بار ویروسی کمی بالاتر را تشخیص داد. روش جمع آوری و استخراج، با این حال، به طور قابل توجهی متفاوت است. استخراج کننده اسید نوکلئیک Chemagic که توسط ARUP استفاده می شود حساسیت تحلیلی بالاتری نسبت به پروتکل غیرفعال سازی و لیز ویروسی مورد استفاده در UW دارد. نویسندگان بر این باورند که تفاوت در فرآیندهای پردازش و استخراج نمونه می‌تواند دلیل تغییر در بارهای ویروسی از دو آزمایشگاه باشد.

جمع آوری سواب های متعدد از یک فرد منجر به همخوانی کلی آزمایش بیش از 95٪ شد. درصد بسیار پایین (کمتر از 1.5٪) برای نتیجه مثبت به سه یا بیشتر آزمایش نیاز داشتند و مقادیر Ct آنها به طور قابل توجهی بالا بود که نشان دهنده بار ویروسی کم بود. سواب‌های خشک معلق در سالین بافر فسفات بارهای ویروسی بالاتری را نسبت به سواب‌های موجود در محیط‌های انتقال ویروس (VTM) نشان دادند که نویسندگان آن را به رقیق شدن بار ویروسی در VTM نسبت می‌دهند.

به گفته نویسندگان، در حالی که نتایج مثبت ناسازگار می تواند به دلیل بارهای ویروسی کم باشد، آلودگی متقاطع را نمی توان به عنوان یک دلیل رد کرد. CDC اخیراً توصیه‌ای درباره خطر ابتلا به موارد مثبت کاذب منتشر کرده و از آزمایشگاه‌ها خواسته است تا دو نمونه را برای نتایج با مقادیر Ct بیشتر از 34 آزمایش کنند.

نتیجه گیری

به طور کلی، این مطالعه نشان داد که نظارت بر فاکتورهای تست MPXV PCR به غیر از نتایج آزمایش کیفی در آزمایشگاه‌های بالینی و مرجع برای درک تفاوت‌ها و بهبود فرآیندهای آزمایش‌های تشخیصی بسیار مفید است.

نویسندگان گزارش می دهند که در حالی که سواب های متعدد از یک فرد هماهنگی کلی تست را بهبود می بخشد، بخش قابل توجهی از امکانات و منابع تست PCR برای یک فرد استفاده می شود که از نظر منابع و زمان ناکارآمد است. بنابراین، آنها در عوض روشی برای ترکیب سواب های متعدد از یک فرد در VTM برای بهبود عملکرد تشخیصی و در عین حال کاهش هزینه های کلی پیشنهاد می کنند.

*تذکر مهم

medRxiv گزارش‌های علمی مقدماتی را منتشر می‌کند که توسط همتایان مورد بررسی قرار نمی‌گیرند و بنابراین، نباید به‌عنوان نتیجه‌گیری، راهنمای عمل بالینی/رفتار مرتبط با سلامت در نظر گرفته شوند یا به عنوان اطلاعات ثابت تلقی شوند.



منبع