نتایج بالینی در بیماران مبتلا به زیر متغیرهای مختلف Omicron چگونه متفاوت است؟


در مطالعه اخیر ارسال شده به medRxiv* سرور پیش چاپ، محققان نتایج بالینی، بارهای ویروسی تنفسی فوقانی و بازیابی ویروسی زیر متغیرهای مختلف Omicron سندرم حاد تنفسی ویروس 2 (SARS-CoV-2) را در کشت سلولی مقایسه می کنند.

مطالعه: زیر متغیرهای Omicron: خصوصیات بالینی، آزمایشگاهی و کشت سلولی.  اعتبار تصویر: Mayboon/Shutterstock
مطالعه: زیر متغیرهای Omicron: خصوصیات بالینی، آزمایشگاهی و کشت سلولی. اعتبار تصویر: Mayboon/Shutterstock

زمینه

از زمانی که نوع SARS-CoV-2 Omicron در نوامبر 2021 ظهور کرد، زیرمجموعه‌های مختلف Omicron تکامل یافته‌اند و دارای جهش‌های جدیدی هستند که به آنها توانایی‌های فرار ایمنی را بهبود می‌بخشد. در حالی که زیرمجموعه BA.1 بیشترین تعداد عفونت را در سراسر جهان بین دسامبر 2021 و ژانویه 2022 ایجاد کرد، هر زیر متغیر جدید جایگزین قبلی شد و فرار خنثی سازی را افزایش داد.

مطالعات نشان داده است که تعداد موارد، شدت عفونت و بستری شدن در بیمارستان یا مرگ و میر بعدی از یک منطقه به منطقه دیگر برای هر یک از متغیرهای فرعی متفاوت است. تنوع جغرافیایی پیامدها می تواند به تعداد عفونت های قبلی و پوشش واکسیناسیون در کشور مربوط باشد. این مطالعه تفاوت‌ها را در پیامدهای بالینی، بار ویروسی و بهبود ویروسی زیرمجموعه‌های مختلف Omicron در ایالات متحده (ایالات متحده) بررسی می‌کند.

در مورد مطالعه

مطالعه حاضر از باقی‌مانده سواب‌های بینی یا نازوفارنکس کناری میانی شاخک از آزمایش بیماران علامت‌دار و بدون علامت در سیستم بهداشت جانز هاپکینز (JHHS) بین دسامبر 2021 تا ژوئیه 2022 استفاده کرد. نمونه‌های بالینی SARS-CoV-2 مثبت برای کل استفاده شد. توالی یابی ژنوم

از داده‌های بالینی و واکسیناسیون بیماران SARS-CoV-2 مثبت برای درک نتایج بالینی هر عفونت فرعی مطابق با وضعیت واکسیناسیون استفاده شد. بارهای ویروسی بر اساس مقادیر آستانه چرخه (Ct) آزمایشات واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) محاسبه شد.

کشت های سلولی VeroE6TMPRSS2 (VT) و VeroE6-ACE2-TMPRSS2 (VAT) با مقدار کمی از نمونه های سواب برای مطالعه بازیابی ویروس آلوده شدند. کشت ها به مدت هفت روز یا تا زمانی که اثر سیتوپاتیک (CPE) عفونت را تایید کند انکوبه شدند. حضور SARS-CoV-2 در سلول های VT و VAT با استفاده از PCR رونوشت معکوس تایید شد.

دوز عفونی کشت بافت 50% (TCID50برای اندازه گیری تیتر ویروس عفونی در سلول های VT و VAT از روش سنجش استفاده شد. برای بررسی همبستگی بین متغیرها از آنالیزهای آماری مختلفی مانند آنالیز مجذور کای، آزمون دقیق فیشر، آزمون U Mann-Whitney و آنالیز واریانس یک طرفه (ANOVA) استفاده شد.

نتایج

نتایج گزارش داد که بالاترین نرخ‌های مثبت SARS-CoV-2 و بستری‌های مرتبط با بیماری کروناویروس 2019 (COVID-19) بین دسامبر 2021 تا ژانویه 2022 در دوره تسلط زیرمجموعه BA.1 بوده است. غلبه BA.1.1 و BA.2 بین فوریه و آوریل 2022 با کاهش موارد و پذیرش در بیمارستان مرتبط بود.

ظهور زیرمتغیرهای BA.2.12.1 و BA.5 منجر به افزایش شدید موارد بین ماه مه و ژوئیه 2022 شد. متغیرهای فرعی که پس از BA.1 ظهور کردند منجر به افزایش جزئی در بستری شدن در بیمارستان شد اما مرگ و میر را کاهش داد.

نویسندگان بر این باورند که تغییر در نرخ بستری شدن در بیمارستان برای هر یک از انواع فرعی می‌تواند به دلیل عواملی مانند افزایش تست‌های خانگی با موارد شدیدی که به دنبال بستری شدن در بیمارستان هستند، و همچنین فصلی بودن با موارد بیشتر COVID-19 در طول ماه‌های سردتر و خشک‌تر باشد. کاهش ایمنی ناشی از واکسیناسیون همچنین می‌تواند عامل افزایش بستری شدن در بیمارستان برای جدیدترین موارد فرعی باشد.

کشت سلولی کاهش بازیابی ویروس های BA.2 و کاهش متناظر در تعداد موارد در طول غلبه BA.2 را نشان داد. این الگو با آنچه در کشورهای دیگر مانند چین، ژاپن و دانمارک مشاهده شد متفاوت بود، که نشان دهنده وابستگی ظهور، گسترش و شدت فرعی به عوامل پاسخ ایمنی در یک جامعه بر اساس عفونت های قبلی و پوشش واکسیناسیون است.

این مطالعه همچنین گزارش داد که BA.1 دارای بالاترین بار ویروسی در دستگاه تنفسی فوقانی در مقایسه با سایر زیر متغیرهای Omicron است. علاوه بر این، BA.5 انتقال و غلبه بالاتری نسبت به BA.4 نشان داد، علیرغم داشتن باقیمانده‌های پروتئین سنبله یکسان و توانایی‌های فرار خنثی‌سازی. دو متغیر فرعی نیز افزایش قابلیت عفونت مجدد را در بیماران مبتلا به عفونت های قبلی BA.1 و BA.1.1 نشان دادند. زیرمتغیر BA.5 همچنین با بازیابی ویروس عفونی بالاتر در کشت سلولی همراه بود.

به گفته نویسندگان، تفاوت در بازیابی ویروس‌های فرعی BA.2 و BA.5 عفونی با افزایش فرار ایمنی نشان‌داده‌شده توسط BA.5 مرتبط است که به افزایش عفونت‌پذیری و افزایش تعداد موارد در طول BA کمک کرد. 5 تسلط.

نتیجه گیری

به طور خلاصه، این مطالعه تعداد موارد، نرخ بستری شدن در بیمارستان، بار ویروسی و بهبودی ویروسی را در کشت‌های سلولی برای گونه‌های Omicron سارس-کوو-2 که در نوامبر 2021 در ایالات متحده ظاهر شد، مقایسه کرد.

یافته ها نشان داد که BA.1 با بیشترین تعداد عفونت همراه بود اما بار ویروسی کمتری نسبت به زیر متغیرهای بعدی Omicron داشت. اگرچه BA.4 و BA.5 دارای ساختارهای پروتئینی سنبله و توانایی فرار ایمنی هستند، BA.5 افزایش انتقال و غلبه و همچنین افزایش بازیابی ویروسی از سواب ها را نشان داد. این مطالعه آلودگی‌پذیری افتراقی زیر متغیرهای Omicron مرتبط با ایمنی ناشی از واکسیناسیون و عفونت قبلی را در کشورهای مختلف برجسته می‌کند.

*تذکر مهم

medRxiv گزارش‌های علمی مقدماتی را منتشر می‌کند که توسط همتایان بررسی نمی‌شوند و بنابراین، نباید به‌عنوان نتیجه‌گیری، راهنمای عمل بالینی/رفتار مرتبط با سلامتی در نظر گرفته شوند یا به عنوان اطلاعات ثابت تلقی شوند.



منبع