نقشه برداری اپی توپ پاسخ های هومورال را علیه پروتئین های ساختاری اصلی SARS-CoV-2 در بیماران مبتلا از آفریقا نشان می دهد.

سپتامبر 24, 2024ژانویه 18, 2023 از دکتر سمیعی

مطالعه حاضر نقش سلول‌های T، یک جزء حیاتی از پاسخ ایمنی هومورال به SARS-CoV-2 را تعیین نکرد. فقدان القای پاسخ سلول T کافی منجر به مرگ برخی از بیماران شدیداً بیمار شد که پاسخ هومورال مناسبی داشتند. اگر مطالعات آینده پپتیدهای شناسایی شده توسط سلول های T را در این بیماران آفریقایی شناسایی کنند، می تواند جالب باشد.

منبع

تجزیه و تحلیل مطالعه تایید کرد که تمام اپی توپ های IgG شناسایی شده نشان دهنده اپی توپ های ایمنی غالب هستند. مطالعات قبلی از قاره های مختلف به طور مشابه پنج و هشت ناحیه اپی توپ IgG را در حوزه های N و S شناسایی کرده اند. بیشتر اپی توپ‌های IgG دارای سیستم ایمنی غالب در خارج از نواحی اتصال گیرنده و دامنه‌های N ترمینال (RBD و NTD) پروتئین SARS-CoV-2 S، مرکز شناخته شده برای اکثر جهش‌های SARS-CoV-2، قرار داشتند. جالب توجه است که بسیاری از این اپی توپ های پپتیدی ایمونودومترال اهداف ثابت شده آنتی بادی های خنثی کننده هستند، به عنوان مثال، S139/140، S165، S204، و S287/288. به همین ترتیب، محققان چندین اپی توپ ایمنی غالب برای IgM پیدا کردند، شاید به این دلیل که نمونه های سرمی را 10 تا 12 روز پس از شروع علائم جمع آوری کردند. با این حال، آنها در این مطالعه، مانند مطالعات قبلی، هیچ اپی توپ غالب ایمنی در پروتئین SARS-CoV-2 E پیدا نکردند.

مشاهدات مهم دیگری که توسط محققان انجام شد این بود که برخی از بیماران شدیداً بیمار دیگر بار SARS-CoV-2 قابل تشخیص در زمان نمونه‌گیری مطالعه نداشتند. همچنین، کسانی که امتیاز بالاتری از آنتی بادی‌های خنثی‌کننده داشتند، بار ویروسی کمتری داشتند، که نشان می‌دهد پاسخ هومورال آنها احتمالا ویروس را از بین می‌برد اما نمی‌توانست به زنده ماندن آنها کمک کند. بیماران گروه شدید، مسن‌تر از گروه‌های علامتدار و بدون علامت بودند و استعداد بالاتری نسبت به COVID-19 داشتند.

نتیجه گیری

علاوه بر این، پاسخ‌های هومورال مشاهده‌شده به SARS-CoV-2 در افراد اهل ماداگاسکار و سنگال کاملاً قابل مقایسه بود، با برخی تفاوت‌ها به دلیل پروفایل‌های مختلف بیمار در زمان نمونه‌گیری. نمونه ها متعلق به بیماران مبتلا به عفونت SARS-CoV-2 در مراحل اولیه یا اواخر بود. بر این اساس، بیماران بدون علامت، اپی توپ های IgM بیشتری داشتند و بیماران مبتلا به کووید-19 شدید به دلیل قرار گرفتن در معرض طولانی مدت SARS-CoV-2 به سمت اپی توپ های IgG تغییر مکان دادند. بر اساس نمرات IgG و IgM، حتی مطالعات قبلی پاسخ ایمنی قوی‌تری را در بیماران مبتلا به کووید-19 در مقایسه با همتایان بدون علامت یا علامت‌دارشان نشان داده‌اند.

در مطالعه حاضر، محققان یک مطالعه نقشه برداری اپی توپ آنتی بادی گسترده در میان واکنش زنجیره ای پلیمراز رونویسی معکوس (RT-PCR) انجام دادند که بیماران مبتلا به SARS-CoV-2 را از دو کشور آفریقایی، سنگال و ماداگاسکار تأیید کرد. آنها همچنین اپی توپ های اولیه سلول B را که توسط این بیماران آفریقایی آلوده به SARS-CoV-2 شناسایی شده بودند، تعیین کردند.

نمونه‌های سرمی مورد استفاده در این مطالعه متعلق به بیمارانی با ریشه‌های قومی متفاوت و پروفایل‌های بیماری متفاوت، به‌عنوان بدون علامت، علامت‌دار و شدید COVID-19 بود.

یافته های مطالعه

بررسی پاسخ‌های ایمنی هومورال در جمعیت‌های مختلف قومی که نمایه‌های بالینی بیماری کروناویروس 2019 (COVID-19) متفاوت را به خود اختصاص می‌دهند، می‌تواند به تعریف بهتر همبستگی‌های محافظت کمک کند. علاوه بر این، می‌تواند به توسعه سنجش‌های تشخیصی سرولوژیکی مؤثرتر و واکسن‌های COVID-19 که برای چنین جمعیت‌هایی اقتباس شده‌اند، کمک کند. به دلیل در دسترس بودن محدود و ناکارآمدی آنها در برابر انواع جدید SARS-CoV-2 (به عنوان مثال، Omicron)، همه گیری کووید-19 پس از تقریباً سه سال از شروعش همچنان به ویران کردن در سطح جهانی ادامه می دهد.

در مورد مطالعه

در مقاله اخیر منتشر شده در گزارش های علمیمحققان نقشه برداری اپی توپ ایمونوگلوبولین (Ig)M و IgG را در برابر 487 پپتید کروناویروس 2 (SARS-CoV-2) با سندرم حاد تنفسی انجام دادند. این پپتیدها شامل چهار پروتئین ساختاری اصلی SARS-CoV-2، به عنوان مثال، گلیکوپروتئین سنبله (S)، پوشش (E)، نوکلئوکپسید (N) و پروتئین های غشایی (M).

*مطالعه: نگاشت اپی توپ خطی پاسخ هومورال علیه SARS-CoV-2 در دو گروه مستقل آفریقایی. اعتبار تصویر: MedMoMedia/Shutterstock*

زمینه

جمعیت مورد مطالعه شامل 65 و 16 (در مجموع 82) بیمار آلوده به SARS-CoV-2 و 32 و 10 (=41) فرد غیر آلوده به ترتیب از سنگال و ماداگاسکار بود. محققان نمونه‌های سرمی را از این دو گروه جمع‌آوری کردند و ارزیابی کردند که آیا توزیع‌های اپی توپ IgM و IgG متفاوت آنها نمایه‌های بالینی متفاوت COVID-19 آنها را توضیح می‌دهد یا خیر. علاوه بر این، آنها نتایج را با مطالعات قبلی از اروپا، آسیا و ایالات متحده آمریکا (ایالات متحده آمریکا) مقایسه کردند.

مجموعه ای از 36 پپتید تو در تو در داخل پروتئین های ساختاری SARS-CoV-2 S و N بیشترین واکنش پذیری را نسبت به آنتی بادی های خنثی کننده از خود نشان دادند. به طور خاص، IgM، IgM/IgG، و IgG بیماران به ترتیب به 9، دو و 25 پپتید SARS-CoV-2 نگاشت شدند. اپی توپ های IgG ایمونودومینانت شناسایی شده مشابه مواردی بود که در مطالعات آسیایی، اروپایی و ایالات متحده توصیف شد. این اپی توپ‌های ایمنی غالب می‌توانند به توسعه واکسن‌های جدید و مؤثرتر و سنجش‌های تشخیصی سرولوژیکی سریع کمک کنند.

به طور کلی، تجزیه و تحلیل مطالعه حاضر تأیید کرد که چشم انداز پاسخ ایمنی هومورال بیماران آفریقایی به SARS-CoV-2 با سایر قاره ها قابل مقایسه است، که نشان دهنده تأثیر حداقل یا عدم تأثیر تنوع در قومیت ها و زمینه ژنتیکی این جمعیت ها است.