یک مطالعه ارتباط گسترده بین تمام فنوتیپ‌های Biobank Japan و rs9367106 نشان داد که آلل طولانی خطر COVID با سرطان ریه مرتبط است.
تجزیه و تحلیل‌های کولوکالیزاسیون نشان داد که سرطان ریه و کووید طولانی مدت سیگنال ژنتیکی یکسانی را در 500 کیلوبایت rs9367106 به اشتراک می‌گذارند. جالب توجه است که نویسندگان همچنین ارتباط ژنتیکی قابل توجهی بین کووید طولانی مدت و علائم افسردگی، آسم و دیابت پیدا کردند.
مانند سایر شرایط پس از ویروسی، کووید طولانی یک موجودیت بیماری ناهمگن است که در آن عوامل ژنتیکی و اپی ژنتیکی سرنوشت بیمار را از نظر خطر بیماری، شدت و بستری شدن در بیمارستان تعیین می کنند.
از آنجایی که FOXP4 در بافت‌های مختلف از جمله ریه‌ها و روده بیان می‌شود، پلی‌مورفیسم‌های آن می‌تواند بر بیماری‌های ریوی مانند کووید طولانی و سرطان و سایر بیماری‌ها تأثیر بگذارد.
مطالعه: مطالعه انجمن ژنومی طولانی کووید. اعتبار تصویر: NiphonSubsri/Shutterstock.com
علاوه بر این، یک رویکرد مبتنی بر پرسشنامه برای ارزیابی علائم دنبال شد.
نتایج
آنها همچنین پیشنهاد کردند که سیگنال FOXP4 یک ارتباط غیرمعمول قوی‌تر با COVID-19 طولانی را نشان می‌دهد، که نمی‌تواند به تنهایی ناشی از شدت COVID-19 باشد.
نتیجه
افرادی که بدون کووید طولانی مدت از عفونت SARS-CoV-2 جان سالم به در بردند، به عنوان کنترل های محکم طبقه بندی شدند، در حالی که نمونه هایی که از نظر ژنتیکی با اجدادشان مطابقت داشتند و طولانی مدت COVID-19 نداشتند، به عنوان کنترل جمعیت طبقه بندی شدند.
*اطلاعیه مهم: medRxiv گزارش‌های علمی مقدماتی را منتشر می‌کند که توسط همتایان بررسی نمی‌شوند و بنابراین، نباید به‌عنوان اطلاعات قطعی، راهنمای عمل بالینی/رفتار مرتبط با سلامتی در نظر گرفته شوند یا به عنوان اطلاعات ثابت تلقی شوند.
زمینه
ناحیه ژنومی اطراف تنوع اولیه مرتبط با COVID طولانی (+/-100 کیلوباز) شامل چهار ژن (FOXP4-AS1، FOXP4، MIR4641، LINC01276) است.
بنابراین، این مطالعه راه را برای تحقیقات آینده هموار می کند و بینش بیشتری را در مورد فرآیندهای بیولوژیکی که زمینه ساز طولانی مدت کووید هستند، می دهد.
از آنجایی که FOXP4 تقریباً در همه بافت‌ها، از جمله سلول‌های ریه و سلول‌های ایمنی، بیان قوی دارد، تجزیه و تحلیل کولوکالیزاسیون بیان متفاوت کووید طولانی مدت را تأیید کرد.
از آنجایی که همه انواع در عدم تعادل پیوند (LD) با واریانت سرب غیر کدگذاری بودند، نویسندگان انواع متصل به ژن‌های مجاور را با بیان دیفرانسیل در یک پنجره 100 کیلوبایتی اسکن کردند.
پژوهش حاضر شواهد ژنتیکی مستقیمی را ارائه می‌کند که آسیب‌شناسی ریه می‌تواند به طور قابل‌توجهی در پیدایش کووید طولانی مدت نقش داشته باشد.
آنها چهار متاآنالیز GWAS را بر اساس یک عفونت تأیید شده با آزمایش انجام دادند که به عنوان یک تعریف دقیق موردی (شامل 11 مطالعه، 3018 = N) و یک عفونت SARS-CoV-2 گزارش شده توسط خود یا پزشک به عنوان کنترل گسترده فهرست شده بود. تعریف (همه در 994582 مطالعه مشارکت دارند).
علاوه بر این، تجزیه و تحلیل توالی تک سلولی نشان داد که FOXP4 به وفور در سلول‌های آلوئولی نوع 2 بیان می‌شود، که پاسخ‌های ایمنی ذاتی قوی را ایجاد می‌کنند، سورفاکتانت ترشح می‌کنند، آلوئول‌ها را خشک نگه می‌دارند و به عنوان سلول‌های پیش ساز در بازسازی اپیتلیوم آسیب دیده عمل می‌کنند.
علاوه بر این، جهش‌های خطر شناخته شده سرطان ریه در زنان آسیایی غیرسیگاری و سرطان ریه سلول غیرکوچک در جمعیت‌های اروپایی و چینی در LD با آلل طولانی خطر COVID است.
در این مطالعه مشترک، محققان اولین GWAS را با تمرکز بر کووید طولانی انجام دادند. آنها 24 GWAS مستقل را در 16 کشور انجام دادند که نشان دهنده جمعیتی از 6 اصل و نسب، 6450 نفر با تشخیص طولانی مدت کووید و 1،093،995 کنترل بود.
علاوه بر این، متاآنالیزهای COVID و Biobank ژاپن انواع این منطقه را به عنوان عوامل خطر برای بستری شدن در بیمارستان مرتبط با COVID-19 برچسب گذاری کردند. تجزیه و تحلیل colocalization انجام شده توسط نویسندگان، هاپلوتیپ خطر FOXP4 هاپلوتیپ شدت COVID-19 را مرتبط کرد.
آنها شناسایی کردند که rs12660421-A (یک آلل پروکسی که با rs9367106-C، آلل طولانی خطر ابتلا به کووید مرتبط است) با افزایش بیان FOXP4 در ریه مرتبط است.
در نهایت، نشان داده شد که یک نوع (rs9381074) مستقیماً با امضاهای متیلاسیون DNA در سلول‌های ایمنی و ریه (H3K27me3 و H3K4me1، H3K27ac، H3K4me3، H3K4me2، H3K4me3) مرتبط است، که نشان می‌دهد آنها در euchromatin قرار دارند.
ابتکار ژنتیک میزبان COVID-19 (HGI) 51 مکان متمایز ژنومی مهم مرتبط با پاتوفیزیولوژی COVID-19 از عفونت تا بستری شدن را شناسایی کرده است.
این تجزیه و تحلیل یک رابطه قوی در سطح ژنوم را در ژن FOXP4 کشف کرد. همچنین مشخص شد که آلل C در rs9367106 با خطر بالاتر ابتلا به کووید طولانی مدت مرتبط است. در هر سه متاآنالیز نتایج یکسانی (اگرچه نه در کل ژنوم) مشاهده شد. rs9367106-C در جایگاه FOXP4 نیز نشان داد که تنوع اپیدمیولوژیکی بالایی دارد.
نویسندگان داده‌ها را از پایگاه‌های داده VannoPortal، Regulome و ENCODE استخراج کردند و چهار نوع مورد علاقه را از طریق توالی تراشه کشف کردند. POLR2A و EP300 rs2894439 را در شروع هاپلوتیپ های خطر و EP300 و FOXA1 rs7741164 و rs55889968 را در میان دیگران محدود کردند.
در مطالعه ای که به medRxiv* سرور پیش چاپ، تیمی از گروه های تحقیقاتی بین رشته ای یک ارتباط قابل توجه ژنومی (GWAS) را برای بیماری طولانی مدت کروناویروس (COVID) در جایگاه FOXP4 شناسایی کردند، که قبلاً با سرطان، کووید 2019 شدید (COVID-19) مرتبط بوده است. عملکرد ریه
*اطلاعیه مهم: medRxiv گزارش‌های علمی مقدماتی را منتشر می‌کند که توسط همتایان بررسی نمی‌شوند و بنابراین، نباید به‌عنوان اطلاعات قطعی، راهنمای عمل بالینی/رفتار مرتبط با سلامتی در نظر گرفته شوند یا به عنوان اطلاعات ثابت تلقی شوند.
علاوه بر این، گرانولوسیت هایی که ایمنی ذاتی را تنظیم می کنند نیز سطح یکسانی از بیان FOXP4 را دارند.
برای درک علل زمینه‌ای کووید طولانی، ارزیابی این گونه‌ها برای روشن کردن مسیرهای ویروسی و مکانیسم‌های ورود ضروری است.
در مورد مطالعه
کووید طولانی به عواقب پس از حاد COVID-19 نیز گفته می شود. در بیماران بستری یا بستری در بخش مراقبت های ویژه به دلیل عفونت COVID-19 شایع تر است. با این حال، ممکن است در بیمارانی که علائم خفیف COVID-19 دارند نیز رخ دهد.