محققان جدایه های بالینی BA.2.75 و B.1.1 (به عنوان شاهد) را به دست آوردند. سپس آنها را به ارگانوئیدهای راه هوایی انسان (AO) تلقیح کردند تا حساسیت BA.2.75 را به سه داروی ضد ویروسی ارزیابی کنند.
در مطالعه اخیر ارسال شده به bioRxiv* سرور پیش چاپ، محققان تمام ویژگی ها، به ویژه خواص آنتی ژنی و پتانسیل انتقال سندرم حاد تنفسی ویروس کرونا 2 (SARS-CoV-2) Omicron فرعی BA.2.75 را ارزیابی کردند.
زمینه
ارزیابی سیستماتیک ویژگی‌های ویروس‌شناسی سارس-کوو-2-ویروس جدید Omicron، BA.2.75، نشان داد که نسبت به BA.2، نرخ رشد، ترکیب‌زایی و بیماری‌زایی ذاتی در جمعیت انسانی بالاتر است. خطر بیشتری برای سلامت جهانی به همراه دارد و به دلیل Ree قابل توجهی بالاتر از BA.2 و BA.5 در هند، همانطور که از طریق نظارت ژنوم مشاهده شد، نویسندگان پیش بینی کردند که BA.2.75 پتانسیل رقابت با BA.2 و BA را دارد. 5.
یافته های مطالعه
به طور خاص، مطالعات باید ارزیابی کنند که آیا BA.2.75 دارای راندمان رشد افزایش یافته در جمعیت انسانی، بیماری زایی بالاتر و پتانسیل فرار از ایمنی هومورال است. فنوتیپ پروتئین S یک عامل کلیدی تعیین کننده بیماری زایی ویروسی است. بنابراین، مطالعات مقاومت به ایمنی هومورال ضد ویروسی را با استفاده از جایگزینی در پروتئین سنبله (S) ارزیابی کرده‌اند. به عنوان مثال، مطالعات نشان داده اند که زیرشاخه های BA.2 و BA.5 به ترتیب در برابر سرم های عفونت BA.1- و BA.2 مقاوم هستند. BA.2.75 ممکن است به احتمال زیاد مقاومت ایمنی را در برابر انواع غالب قبلی به دست آورد تا بتواند از آنها رقابت کند.
زیرمتغیر Omicron BA.2.75، از نوادگان Omiron فرعی BA.2، از نظر فیلوژنتیکی با نسل غالب فعلی آن BA.5 متفاوت است. بررسی ویژگی‌های ویروسی آن برای تأیید اینکه آیا تهدید بیشتری برای سلامت عمومی جهانی نسبت به سویه اصلی آن BA.2 و سایر زیرشاخه‌های Omicron، از جمله BA.5 است، بسیار مهم است.
پنج مورد از این جهش ها در داخل دامنه N ترمینال (NTD) و بقیه در داخل دامنه اتصال گیرنده (RBD) قرار دارند. برخی از این جهش‌های RBD ممکن است مسئول تغییر حساسیت خنثی‌سازی آن نسبت به آنتی‌بادی‌های مونوکلونال درمانی (mAbs) مشتق‌شده از سرم‌های افراد آلوده به BA.2 و BA.5 باشند. به طور کلی، ظهور BA.2.75 این نگرانی را ایجاد کرده است که SARS-CoV-2 به طور مداوم در حال تکامل است تا از خنثی شدن توسط واکسیناسیون یا آنتی بادی های ناشی از عفونت و mAb های مورد استفاده بالینی فرار کند.
در مورد مطالعه
علاوه بر این، نویسندگان مشاهده کردند که جهش D339H، که در BA.2.75 S منحصر به فرد است، به افزایش میل اتصال ACE2 آن کمک کرد. مدل ساختاری محاسبه شده توسط AlphaFold2 نشان داد که جایگزینی D339H بر موقعیت حلقه اتصال اسید لینولئیک بین باقیمانده‌های 367-378 تأثیر می‌گذارد و در نتیجه میل اتصال به ACE2 را افزایش می‌دهد.
علاوه بر این، محققان شبه‌ویروس‌های حاوی پروتئین‌های S از زیرشاخه‌های Omicron – B.1.1، BA.2، BA.5 و BA.2.75 تولید کردند تا حساسیت آنها را به سرم‌های انسانی افراد واکسینه شده و مبتلا به SARS-CoV-2 آزمایش کنند. آنها همچنین حساسیت خنثی سازی سرم هامسترهای آلوده را در 16 روز پس از عفونت (dpi) ارزیابی کردند. همچنین، آنها مشتقات مبتنی بر BA.2 S حاوی جایگزینی BA.2.75 را برای مشخص کردن جایگزین‌های مسئول ایمنی‌زایی متفاوت BA.2.75 S آماده کردند.
درونکشتگاهی آزمایش‌ها نشان داد که BA.2.75 در سلول‌های اپیتلیال آلوئولی کارآمدتر از BA.2 تکثیر می‌شود، اما نه در سلول‌های اپیتلیال راه هوایی، که بیشتر همجوشی‌زایی آن را از طریق تکامل پروتئین S مستقل از BA.5 تأیید می‌کند. با وجود اینکه هر دو از فرزندان BA.2 هستند، BA.2.75 و BA.5 ایمنی زایی متفاوتی از خود نشان دادند. در حالی که ایمنی زایی BA.2.75 با BA.2 قابل مقایسه بود، در برابر ایمنی ناشی از BA.5 بسیار مقاوم بود. علاوه بر این، جهش G446S آن را در برابر اثرات ضد ویروسی سرم های همستر آلوده به BA.2 و BA.5 مقاوم کرد. نویسندگان همچنین خاطرنشان کردند که سه مورد از پنج جایگزینی NTD در BA.2.75 ارتباط نزدیکی با پتانسیل فرار آن از ایمنی هومورال ناشی از BA.5 داشتند. در آینده، BA.2.75 ممکن است باقیمانده W152 را بیشتر جهش دهد تا از خنثی شدن توسط سرم افراد در حال نقاهت یا واکسینه شده جلوگیری کند.
در مطالعه حاضر، محققان به طور جامع زیرشاخه Omicron BA.2.75 را از جمله سرعت رشد آن در انسان، پتانسیل فرار از ایمنی هومورال، مقاومت در برابر ترکیبات ضد ویروسی، عملکردهای پروتئین S آن مشخص کردند. درونکشتگاهی، و بیماری زایی ذاتی. آنها یک مدل سلسله مراتبی بیزی برای مقایسه Re نسبی بین BA.5 و BA.2.75 در هند ساختند و تفاوت های منطقه ای را در نظر گرفتند.
bioRxiv گزارش‌های علمی مقدماتی را منتشر می‌کند که توسط همتایان بررسی نمی‌شوند و بنابراین، نباید به‌عنوان نتیجه‌گیری، راهنمای عمل بالینی/رفتار مرتبط با سلامتی در نظر گرفته شوند یا به عنوان اطلاعات ثابت تلقی شوند.
مطالعات اولیه روی BA.2.75 همچنین افزایش بالقوه ای را در مقدار نسبی تولید مثل موثر (Re) در مقایسه با BA.5 و BA.2 اصلی نشان داده است و این نگرانی را ایجاد می کند که ممکن است به زودی از BA.5 پیشی بگیرد و سارس غالب بعدی باشد. -به زودی نوع CoV-2 در 23 جولای 2022، Nextstrain BA.2.75 را به عنوان یک کلاد جدید، 22D طبقه بندی کرد. در مقایسه با BA.2 S، BA.4/5 دارای چهار جهش در پروتئین S خود است، در حالی که BA.2.75 دارای 9 جهش است، یعنی K147E، W152R، F157L، I210V، G257S، و D339H، G446S، N460K، و R493Q.
خوشبختانه، BA.2.75 حساسیت خود را به سه داروی اصلی ضد SARS-CoV-2، از جمله Remdesivir، EIDD-1931، و Nirmatrelvir حفظ کرد و به Remdesivir حساسیت بیشتری داشت.
نتیجه گیری
با توجه به پیدایش، BA.2.75 به طور مستقل از یک نسل دیگر BA.2، BA.5 پدید آمد. نتایج آزمایش‌های همجوشی مبتنی بر سلول، راه هوایی روی تراشه و سنجش پلاک نشان داد که پس از جدا شدن از BA.2، مشابه BA.5، ترکیب‌زایی بالاتری به دست آورد. نویسندگان خاطرنشان کردند که جایگزینی L452R در BA.5 S باعث ترکیب‌زایی بالاتری شد. برعکس، جایگزینی N460K در BA.2.75 S آن را ترکیبی تر کرد.
به دلیل مقاومت بالاتر در برابر ایمنی ناشی از BA.5، BA.2.75 ممکن است در کشورهایی که BA.5 در آنها در حال گردش است (به عنوان مثال، استرالیا) به طور موثرتری پخش شود. به طور کلی، این مطالعه نیاز به نظارت مستمر و دقیق BA.2.75 را از طریق همکاری جهانی برای نظارت ژنومی ویروسی برجسته کرد.
*تذکر مهم