پروفایل های اپی ژنتیک سلول های لوسمی می تواند به تشخیص و درمان کمک کند

تحقیقات در آزمایشگاه‌های زیست‌پزشکی در سال‌های اخیر به‌طور چشمگیری تغییر کرده است، تا جایی که لوله‌های آزمایش در موارد بسیاری جای خود را به رایانه‌ها داده‌اند. در این زمینه، بسیاری از اکتشافات در حال حاضر با مطالعات دقیق پایگاه‌های داده مولکولی و سلولی آغاز می‌شود و به دنبال آن اعتبارسنجی و گسترش این نتایج از طریق آزمایش‌های انجام شده در روکش سفید آزمایشگاهی کلاسیک، و در نهایت با ترجمه این دانش به محیط‌های بالینی، به لطف متخصصان کت، انجام می‌شود. سفید در بیمارستان ها به اصطلاح “مهندسی پایگاه داده” درهای تحقیقات زیست پزشکی را برای بسیاری از دانشمندان رایانه و ریاضیدانان که اغلب نقش های کلیدی را در این صفحه شطرنج بازی می کنند، باز کرده است.

امروز مقاله ای در این مجله منتشر شد سرطان خون، بخشی از طبیعت این گروه به سرپرستی دکتر مانل استلر، پروفسور تحقیقاتی ICREA در موسسه تحقیقات لوسمی جوزپ کارراس (IJC) و رئیس گروه ژنتیک در دانشکده پزشکی دانشگاه بارسلون، نمونه جدیدی از قدرت بیوانفورماتیک توسط بیوانفورماتیک را ارائه می‌کند. این امکان را برای جامعه علمی فراهم می کند که اپی ژنتیک بیش از 200 خط را نشان دهد. این اثر ابتدا توسط دکتر الکس نوگویرا کاستیلز نوشته شد و با همکاری آزمایشگاه دکتر جوزپ ماریا ریبرا، همچنین از موسسه جوزپ کارراس، انجام شد.

دکتر استلر توضیح می دهد که تیم به دست آورده است پروفایل های اپی ژنتیک جامع ترین مجموعه سلول های کشت شده مشتق شده از سلول های تبدیل شده در جریان خون، مغز استخوان و غدد لنفاوی تا به امروز، با مطالعه بیش از 800000 مکان اصلاح ژنوم به دلیل متیلاسیون DNA.. این شامل نمونه‌های بدخیم انسان و موش است که الگوهای به‌دست‌آمده را برای محققان پایه، کاربردی و بالینی مفید می‌سازد.

استلر نیز این را تایید می کند یک نکته مهم این است که ژنوم هایی که به دست آوردیم بسیار شبیه به تومورهای اولیه بیماران است. این بدان معناست که با استفاده از الگوریتم‌های محاسباتی، این پایگاه می‌تواند به عنوان مرجعی برای تشخیص سرطان خون در مواقعی که در مورد هویت و طبقه‌بندی آن تردید وجود دارد، عمل کند. “ما قبلا موفقیت این روش را با تومورهای مغزی و سارکوم ثابت کرده ایمدکتر استلر بیان می کند.

علاوه بر توصیف خالص ژنوم اپی ژنتیک سلول های بدخیم، این مطالعه همچنین داده های ژنتیکی را با اطلاعات مربوط به حساسیت بیش از 300 دارو مقایسه کرد.اکنون، یک الگوریتم جداگانه می تواند پیش بینی کند که کدام ضایعه اپی ژنتیک با آلرژی یا مقاومت دارویی مرتبط است.به گفته دکتر استلر، این یک نقطه عطف مهم برای تحقیقات بالینی است.

همراه با در دسترس بودن گسترده داده ها، آپلود شده در مخازن عمومی آنلاین، تیم تحقیقاتی مطمئن است که مشخصات گزارش شده مرتبط با حساسیت دارویی به عنوان یک دارایی ارزشمند برای شناسایی صحیح تومورهای با منشا ناشناخته و کمک به تعیین بهترین گزینه درمانی عمل می کند.

این تحقیق تا حدی توسط کمک های مالی دولت های اسپانیا و کاتالان، بنیاد CELEX، بنیاد “La Caixa” و انجمن اسپانیایی علیه سرطان (AECC) تامین شد. در نوشتن این مقاله خبری از هیچ ابزار هوش مصنوعی مولد استفاده نشده است.